日本的旅馆分为偏向于日式或称和式的“旅馆”和偏向洋式的“饭店”。
日式旅馆大多为木结构建筑，室内没有床，客人睡地铺（塌塌米），桌椅也较低矮，甚至可以说是就铺个垫子，席地而坐。它强调的是主动服务，力求给客人一种“回家”之感。
值得一提的是，和式旅馆不仅比洋式饭店便宜，而且多是“一宿两餐”，即房租里面就包括早晚两餐，因此颇具吸引力。
座舱式旅馆
舱式旅馆大多设置在城市内的大型车站的附近，宿费便宜，专为未赶上末班电车的工薪族利用。此类型的旅馆大多为上下两层，相连排列，形式有如中国火车上的卧铺车厢，所不同的是，这里的卧铺呈座舱状，每个座舱深2米，宽和高各1米，座舱内面积窄小，但电视、照明等设备一应俱全。客人投宿时办理好住宿手续，拿到与座舱相同号码的存物箱钥匙，将行李存入存物箱内，换上里面预先放好的睡衣，到附属的桑拿浴室冲澡桑拿后，就可钻入属于自己的座舱、放下帘子就寝。
民宿
所谓的民宿其实是全民办旅游的一种客观反映，那些家住海边或名胜古迹附近的人家。民宿的经营方式与和式旅馆相近，但因其多是兼业经营，并不主要经营旅馆，故规模较小，家庭气息更浓。
温泉观光饭店
多火山的地形为日本造就了许许多多的温泉，日本人多爱清洁，洗温泉是日本人不可缺少的一大享受。因此，凡有温泉的地方皆有饭店、旅馆。旅馆内的温泉有大有小，大的可供数百人同时入浴，小的仅能容纳1人。除了普通的浴池外，有的还有冲浪浴、花浴、药浴等多种名堂。
爱情旅馆
也称作情人旅馆。大凡日本的大中城市的大型车站和繁华的高速公路出入口处附近，多设有爱情旅馆。此类旅馆不仅外形浪漫，夜间的霓虹灯也格外耀眼。客人进门后在前厅就可看到镶有照片的房间介绍，选择好房间后到服务台领取钥匙，休息过后只要按标示付足租金即可离去。这类旅馆是按小时收费，分为“住宿”和“休息”两种标准。
宿坊
所谓的宿坊即为寺庙办的旅馆。寺庙本是专供僧侣生活居住的地方，但部分住房有余的寺庙也开放部分房屋供参拜者住宿。唯一不便之处是，在寺庙内投宿只能吃素食，不得沾荤。